Biopython - 安装

本节介绍如何在您的计算机上安装 Biopython。安装非常简单，不会超过五分钟。

第 1 步- 验证 Python 安装

Biopython 设计用于与 Python 2.5 或更高版本配合使用。所以，必须先安装python。在命令提示符中运行以下命令 -

> python --version

它的定义如下 -

验证 Python 安装

如果安装正确，它会显示 python 的版本。否则，请下载最新版本的 python，安装它，然后再次运行该命令。

步骤 2 - 使用 pip 安装 Biopython

在所有平台上使用 pip 从命令行轻松安装 Biopython。输入以下命令 -

> pip install biopython

您的屏幕上将显示以下响应 -

使用 pip 安装 Biopython

用于更新旧版本的 Biopython -

> pip install biopython –-upgrade

您的屏幕上将显示以下响应 -

更新旧版本

执行此命令后，旧版本的 Biopython 和 NumPy（Biopython 依赖于它）将被删除，然后再安装最新版本。

步骤 3 - 验证 Biopython 安装

现在，您已经在计算机上成功安装了 Biopython。要验证 Biopython 是否已正确安装，请在 python 控制台上键入以下命令 -

验证 Biopython 安装

它显示了 Biopython 的版本。

替代方法 - 使用源代码安装 Biopython

要使用源代码安装 Biopython，请按照以下说明操作 -

从以下链接下载最新版本的 Biopython - https://biopython.org/wiki/Download

截至目前，最新版本是biopython-1.72。

下载文件并解压压缩存档文件，进入源代码文件夹并输入以下命令 -

> python setup.py build

这将从源代码构建 Biopython，如下所示 -

使用源安装 Biopython

现在，使用以下命令测试代码 -

> python setup.py test

测试代码

最后，使用以下命令安装 -

> python setup.py install

最后安装