- Biopython 教程
- Biopython - 主页
- Biopython - 简介
- Biopython - 安装
- 创建简单的应用程序
- Biopython - 序列
- 高级序列操作
- 顺序 I/O 操作
- Biopython - 序列比对
- Biopython - BLAST 概述
- Biopython - Entrez 数据库
- Biopython - PDB 模块
- Biopython - 图案对象
- Biopython - BioSQL 模块
- Biopython - 群体遗传学
- Biopython - 基因组分析
- Biopython - 表型微阵列
- Biopython - 绘图
- Biopython - 聚类分析
- Biopython - 机器学习
- Biopython - 测试技术
- Biopython 资源
- Biopython - 快速指南
- Biopython - 有用的资源
- Biopython - 讨论
Biopython - 测试技术
Biopython 有丰富的测试脚本来在不同条件下测试软件,以确保软件没有错误。要运行测试脚本,请下载 Biopython 的源代码,然后运行以下命令 -
python run_tests.py
这将运行所有测试脚本并给出以下输出 -
Python version: 2.7.12 (v2.7.12:d33e0cf91556, Jun 26 2016, 12:10:39) [GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] Operating system: posix darwin test_Ace ... ok test_Affy ... ok test_AlignIO ... ok test_AlignIO_ClustalIO ... ok test_AlignIO_EmbossIO ... ok test_AlignIO_FastaIO ... ok test_AlignIO_MauveIO ... ok test_AlignIO_PhylipIO ... ok test_AlignIO_convert ... ok ........................................... ...........................................
我们还可以运行单独的测试脚本,如下所示 -
python test_AlignIO.py
结论
据了解,Biopython是生物信息学领域的重要软件之一。它是用Python编写的(易于学习和编写),提供了广泛的功能来处理生物信息学领域的任何计算和操作。它还为几乎所有流行的生物信息学软件提供简单灵活的接口,以利用其功能。