Biopython - 测试技术


Biopython 有丰富的测试脚本来在不同条件下测试软件,以确保软件没有错误。要运行测试脚本,请下载 Biopython 的源代码,然后运行以下命令 -

python run_tests.py

这将运行所有测试脚本并给出以下输出 -

Python version: 2.7.12 (v2.7.12:d33e0cf91556, Jun 26 2016, 12:10:39) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] 
Operating system: posix darwin 
test_Ace ... ok 
test_Affy ... ok 
test_AlignIO ... ok 
test_AlignIO_ClustalIO ... ok 
test_AlignIO_EmbossIO ... ok 
test_AlignIO_FastaIO ... ok 
test_AlignIO_MauveIO ... ok 
test_AlignIO_PhylipIO ... ok 
test_AlignIO_convert ... ok 
........................................... 
...........................................

我们还可以运行单独的测试脚本,如下所示 -

python test_AlignIO.py

结论

据了解,Biopython是生物信息学领域的重要软件之一。它是用Python编写的(易于学习和编写),提供了广泛的功能来处理生物信息学领域的任何计算和操作。它还为几乎所有流行的生物信息学软件提供简单灵活的接口,以利用其功能。